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Enregistrement W1514216814 · doi:10.1111/jbi.12578

A peripheral view: post‐glacial history and genetic diversity of an amphibian in northern landscapes

2015· article· en· W1514216814 sur OpenAlexafffundabout
A.‐M. D'Aoust‐Messier, David Lesbarrères

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensLaurentian University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Natural Resources
Mots-clésGenetic diversityBiologyRefugium (fishkeeping)Genetic structureEcologyEvolutionary biologyPhylogeographyNucleotide diversityContext (archaeology)MicrosatellitePopulationRange (aeronautics)Genetic variationPhylogenetic treeHaplotypeHabitatGeneticsPaleontologyAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim Where post‐glacial colonization and founder events are numerous, peripheral populations tend to have reduced genetic diversity as compared to their centrally located counterparts. Such decrease in genetic variability can limit their potential to adapt to changes in their environment. At northern latitudes for instance, populations are often living in conditions close to their physiological limits. Thus, identifying the levels of genetic diversity in peripheral populations is key to estimating the potential for adaptation to ongoing environmental change. In this context, we investigated the distribution of genetic diversity at the northern edge of the wood frog's (Lithobates sylvaticus) range by reconstructing its post‐glacial history in an area where phylogeographical data were lacking. Location James Bay area (north‐central Canada). Methods DNAwas extracted from 463 wood frog tissue samples from 17 localities. Seven microsatellite loci were used to quantify genetic diversity and evaluate genetic structure through estimates of the fixation index, isolation‐by‐distance analyses and Bayesian clustering algorithms (tessandstructure). Phylogeographical relationships were investigated using single nucleotide polymorphisms in theND2/tRNATRPmitochondrial genes. Phylogenetic trees were built using the neighbour‐joining and the maximum likelihood inference methods implemented inmega5. Results Our analyses identified a contact zone between two colonizing lineages originating from one glacial refugium. Populations in this contact zone present sympatrically distributed haplotypes from both lineages and higher genetic variation than the surrounding populations. Population structure analyses revealed the differentiation of three genetic clusters, each covering large areas around the coast of James Bay. Main conclusions Our study suggests that higher than expected genetic diversity and gene flow may be present in peripheral populations. Such adaptive potential is critical in areas of upcoming development and environmental changes. Thus, our study emphasizes the importance of understanding species post‐glacial history for the prediction of future evolutionary trends and species distributions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,039

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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