Partial organization of bovine variable-heavy chain gene locus and influence of recombination signal sequences (RSS) on various variable region gene expression (42.6)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract An attempt has been made to determine the organization of variable-heavy chain gene locus in cattle, based on 91% assembled Hereford cow genome sequence, where both functional VH and pseudogenes are identified on chromosome 7 and 21. Of a total of 13 VH genes identified unambiguously, 6 VH genes are located on chromosome 21 and 7 VH genes are present on chromosome 7. Interestingly, the functional VH genes are distributed on both chromosome 7 and 21 raising questions about VDJ recombination occurring on two different chromosomes (Hosseini, A. et al. 2004. Int. Immunol.16:843) or via as yet unidentified mechanism that possibly permitted allelic exclusion. The presence of 10 DH-genes in the Hereford genome is confirmed as earlier reported by our laboratory (Koti, M. et al. 2010. Mol Immunol. 47:2119). Come cryptic recombination signal sequences (RSS) seem to exist within the VH encoding region requiring elucidation of their role in VDJ recombination. Nevertheless, V-gene expression in bovine B cells is influenced by the composition of RSSs. These findings, especially the presence of variable heavy chain locus on two chromosomes, raise fundamental questions about the phenomenon and mechanisms of allelic exclusion in bovine B cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».