An unusual tandem‐domain rhodanese harbouring two active sites identified in <i>Desulfitobacterium hafniense</i>
Notice bibliographique
Résumé
The rhodanese protein domain is common throughout all kingdoms of life and is characterized by an active site cysteine residue that is able to bind sulfane sulfur and catalyse sulfur transfer. No unique function has been attributed to rhodanese-domain-containing proteins, most probably because of their diversity at both the level of sequence and protein domain architecture. In this study, we investigated the biochemical properties of an unusual rhodanese protein, PhsE, from Desulfitobacterium hafniense strain TCE1 which we have previously shown to be massively expressed under anaerobic respiration with tetrachloroethene. The peculiarity of the PhsE protein is its domain architecture which is constituted of two rhodanese domains each with an active site cysteine. The N-terminal rhodanese domain is preceded by a lipoprotein signal peptide anchoring PhsE on the outside of the cytoplasmic membrane. In vitro sulfur-transferase activity of recombinant PhsE variants was measured for both domains contrasting with other tandem-domain rhodaneses in which usually only the C-terminal domain has been found to be active. The genetic context of phsE shows that it is part of a six-gene operon displaying homology with gene clusters encoding respiratory molybdoenzymes of the PhsA/PsrA family, possibly involved in the reduction of sulfur compounds. Our data suggest, however, that the presence of sulfide in the medium is responsible for the high expression of PhsE in Desulfitobacterium, where it could play a role in the sulfur homeostasis of the cell.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».