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Enregistrement W1518246518 · doi:10.4161/hv.24460

On the benefits of sin

2013· review· en· W1518246518 sur OpenAlexafffund
Matthew S. Parsons, Sybille Müller, Heinz Köhler, Michael D. Grant, Nicole F. Bernard

Notice bibliographique

RevueHuman Vaccines & Immunotherapeutics · 2013
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSomatic hypermutationRepertoireBiologyAntibodyIdiotypeVirologyAntibody RepertoireAntigenImmune systemImmunologyAffinity maturationImmunoglobulin IdiotypesB cellMonoclonal antibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antibodies (Abs) induced during infections with immunodeficiency viruses are subject to a form of original antigenic sin, termed repertoire freeze. This phenomenon encompasses conditions in which antigen (Ag)-specific B-cells and free Ab induced against early viral variants recognize viral escape mutants sufficiently to compete for Ag with naïve B-cells. As previously activated Ag-specific Abs and B-cells are more abundant than their naïve counterparts, they out-compete naïve B-cells and can be selected to undergo repeated rounds of somatic hypermutation and affinity maturation that drive repeated rounds of immune selection and viral escape. This situation prevents or diminishes the ability of B-cells carrying novel Ab-specificities to become activated and produce free Ab, facilitating viral escape. The enactment of repertoire freeze is illustrated in several features of anti-HIV antibodies, including persistently skewed κ/λ light chain ratios, preferential variable region gene usage, and the accumulation of Abs with extensive mutations within their variable regions. Furthermore, several investigators documented the presence of anti-viral Abs carrying a common idiotype, designated 1F7, from early infection onwards. In fact, anti-idiotypic suppression of these Abs in SHIV-infected rhesus macaques allowed the development of Abs that more effectively neutralized autologous contemporaneous viruses. Although most research suggests that repertoire freeze is undesirable for controlling an active infection, recent evidence has demonstrated that potentially protective broadly neutralizing Abs (BnAbs) develop within the freeze susceptible 1F7-idiotypic repertoire. This observation suggests that repeated rounds of selection of 1F7-idiotypic Abs may drive the extensive variable region mutation that characterizes BnAbs. In this review, we address how the demonstrated overlap between 1F7-idiotypic repertoire freeze and potentially protective Ab responses can be unravelled to generate novel vaccine concepts. Furthermore, we address how idiotypic regulation of the humoral immune response could be useful for sustaining protective Ab responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,094

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0280,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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