MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1519350423 · doi:10.2741/a929

Molecular epidemiology of Pseudomonas Aeruginosa

2002· review· en· W1519350423 sur OpenAlexafffund
David P. Speert

Notice bibliographique

RevueFrontiers in bioscience · 2002
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensBritish Columbia Centre of Excellence for Women's Health
Organismes subventionnairesBritish Columbia Lung AssociationCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésPseudomonas aeruginosaEpidemiologyMolecular epidemiologyMicrobiologyBiologyComputational biologyMedicineGeneticsBacteriaInternal medicineGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa is a serious opportunistic pathogen in certain compromised hosts, such as those with cystic fibrosis, thermal burns and cancer. It also causes less severe noninvasive disease, such as otitis externa and hot tub folliculitis, in normal hosts. P. aeruginosa is phenotypically very unstable, particularly in patients with chronic infection. Phenotypic typing techniques are useful for understanding the epidemiology of acute infections, but they are limited by their discriminatory power and by their inability to group isolates that are phenotypically unrelated but genetically homologous. Molecular typing techniques, developed over the past decade, are highly discriminatory and are useful for typing strains from patients with chronic infection where the bacterial phenotype is unstable; this is particularly true in cystic fibrosis, where patients often are infected with the same strain for several decades, but the bacteria undergo phenotypic alteration. Molecular typing techniques, which have proven useful in typing P. aeruginosa for epidemiological purposes, include pulsed field gel electrophoresis, restriction fragment length polymorphic DNA analysis, random amplified polymorphic DNA analysis, repetitive extrapalindromic PCR analysis, and multilocus sequence typing. These methods are generally only available in specialized laboratories, but they should be used when data from phenotypic typing analysis are ambiguous or when phenotypic methods are unreliable, such as in cystic fibrosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,067
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in bioscienceMême sujetPlant Pathogenic Bacteria StudiesTravaux en français237 207