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Enregistrement W1519401338 · doi:10.1186/1471-2156-1-1

Human cytomegalovirus IE1 promoter/enhancer drives variable gene expression in all fiber types in transgenic mouse skeletal muscle

2000· article· en· W1519401338 sur OpenAlexafffund
Patricia L. Hallauer, Kenneth E.M. Hastings

Notice bibliographique

RevueBMC Genetics · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaKillam Trusts
Mots-clésEnhancerTransgeneBiologyGenetically modified mouseGene expressionMolecular biologySkeletal muscleGeneGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Versatile transgenic manipulation of skeletal muscle requires knowledge of the expression profiles of diverse promoter/enhancer elements in the transcriptionally specialized fiber types of which muscle is composed. "Universal" viral promoters/enhancers, e.g., cytomegalovirus IE1 (CMV IE1), are of interest as reagents that may drive broad expression. However, a previous study noted a marked heterogeneity of CMV IE1-driven transgene expression among muscle fibers, raising the possibility of fiber-type-restricted expression. The purpose of the present study was to characterize CMV IE1-driven expression in terms of fiber type. RESULTS: We produced two lines of transgenic mice carrying the CMV IE1/ beta-galactosidase construct CMVLacZ, and analyzed transgene expression and fiber type by histochemical analysis of hindlimb muscle sections. In both lines CMVLacZ was expressed in all four major fiber types: type I (slow) and types IIA, IIB and IIX (fast). There was no unique pattern of fiber-type-preferential expression; fiber-type quantitative differences were observed but details varied between muscle regions and between lines. Both lines showed similar fiber-type-independent regional differences in overall expression levels, and a high level of within-fiber-type variability of expression, even among nearby fibers. The soleus muscle showed strong expression and comparatively little within-fiber-type or between-fiber-type variability. CONCLUSIONS: The CMV IE1 promoter/enhancer is not fiber-type-restricted and can be useful for driving germ-line transgene expression in all four fiber types. However, not all fibers express the gene at high levels due in part to regional differences in overall expression levels, and to a high level of within-fiber-type variability. Given the multinucleate syncitial nature of muscle fibers, it is not likely that this variability is due to variegating heterochromatinization. The soleus muscle would make a suitable subject for near-uniform experimental gene expression driven by CMV IE1 elements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,871

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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