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Enregistrement W1519401338 · doi:10.1186/1471-2156-1-1

Human cytomegalovirus IE1 promoter/enhancer drives variable gene expression in all fiber types in transgenic mouse skeletal muscle

2000· article· en· W1519401338 sur OpenAlexafffund
Patricia L. Hallauer, Kenneth E.M. Hastings

Notice bibliographique

RevueBMC Genetics · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaKillam Trusts
Mots-clésEnhancerTransgeneBiologyGenetically modified mouseGene expressionMolecular biologySkeletal muscleGeneGeneticsEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Versatile transgenic manipulation of skeletal muscle requires knowledge of the expression profiles of diverse promoter/enhancer elements in the transcriptionally specialized fiber types of which muscle is composed. "Universal" viral promoters/enhancers, e.g., cytomegalovirus IE1 (CMV IE1), are of interest as reagents that may drive broad expression. However, a previous study noted a marked heterogeneity of CMV IE1-driven transgene expression among muscle fibers, raising the possibility of fiber-type-restricted expression. The purpose of the present study was to characterize CMV IE1-driven expression in terms of fiber type. RESULTS: We produced two lines of transgenic mice carrying the CMV IE1/ beta-galactosidase construct CMVLacZ, and analyzed transgene expression and fiber type by histochemical analysis of hindlimb muscle sections. In both lines CMVLacZ was expressed in all four major fiber types: type I (slow) and types IIA, IIB and IIX (fast). There was no unique pattern of fiber-type-preferential expression; fiber-type quantitative differences were observed but details varied between muscle regions and between lines. Both lines showed similar fiber-type-independent regional differences in overall expression levels, and a high level of within-fiber-type variability of expression, even among nearby fibers. The soleus muscle showed strong expression and comparatively little within-fiber-type or between-fiber-type variability. CONCLUSIONS: The CMV IE1 promoter/enhancer is not fiber-type-restricted and can be useful for driving germ-line transgene expression in all four fiber types. However, not all fibers express the gene at high levels due in part to regional differences in overall expression levels, and to a high level of within-fiber-type variability. Given the multinucleate syncitial nature of muscle fibers, it is not likely that this variability is due to variegating heterochromatinization. The soleus muscle would make a suitable subject for near-uniform experimental gene expression driven by CMV IE1 elements.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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