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Enregistrement W1520347600 · doi:10.1002/9780470513736.ch8

Clonal Changes in Tumours During Growth and Progression Evaluated by Southern Gel Analysis of Random Integrations of Foreign DNA

2007· review· en· W1520347600 sur OpenAlexaff
Robert S. Kerbel, Carol Waghorne, Bożena Korczak, Martin L. Breitman

Notice bibliographique

RevueNovartis Foundation symposium · 2007
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésclone (Java method)BiologyTransfectionRetrovirusVector (molecular biology)In vivoPrimary tumorCellCancer researchMetastasisDNACell cultureGeneCancerGeneticsRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have exploited random integrations of foreign DNA as a means of genetically tagging tumour cell populations with which to analyse the clonal evolution of tumour growth in vivo. Transfection of a non-metastatic mouse mammary carcinoma called SP1 (or a metastatic variant, SP1HU9L) with the pSV2neo plasmid or retrovirus vector infection with a "clipped-wing' vector (delta p delta eMoTN) was used to generate large numbers of uniquely marked tumour cell clones in single-step selections. The basic approach was to pool large numbers of independently marked transfectants or infectants, inject these cells into mice and analyse the resulting primary tumours and/or metastases later. Overgrowth or derivation of tumour masses by a limited number of clones could be detected by Southern gel analysis. The main findings were: (i) injection of pooled populations containing large numbers of uniquely marked cell clones (up to several thousand) invariably resulted in advanced primary tumours that contained a very limited number of clones, and in some cases only one easily detectable clone; (ii) primary tumours could be overgrown within six weeks by the progeny of the same single metastatic clone when the inoculum contained 1-10% metastatic cells, which suggests that metastatic SP1 cells have a selective growth advantage in primary tumours as well as for metastatic spread; and (iii) spontaneous lung metastases were clonal or biclonal at the time of analysis. The results show that spontaneous metastases can develop from a genetically distinct subpopulation of cells in a non-random (i.e. selective) manner. Because primary tumours can become overgrown by the progeny of a metastatic clone, results of any comparison of the properties of a primary tumour with a distant metastasis could be affected by the stage at which the primary tumour is removed and analysed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,246
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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