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Enregistrement W1521003697 · doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04361.x

Solution structure of Cu<sub>6</sub> metallothionein from the fungus <i>Neurospora crassa</i>

2004· article· en· W1521003697 sur OpenAlexaff
Paul A. Cobine, Ryan T. McKay, Klaus Zangger, Charles T. Dameron, Ian M. Armitage

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueTrace Elements in Health
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesAustrian Science FundUniversity of MinnesotaNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésNeurospora crassaMetallothioneinHomonuclear moleculeCrystallographyChemistryNuclear magnetic resonance spectroscopyCysteineCopperMetalStereochemistryProtein structureZincMoleculeBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 3D-solution structure of Neurospora crassa Cu(6)-metallothionein (NcMT) polypeptide backbone was determined using homonuclear, multidimensional (1)H-NMR spectroscopy. It represents a new metallothionein (MT) fold with a protein chain where the N-terminal half is left-handed and the C-terminal half right-handedly folded around a copper(I)-sulfur cluster. As seen with other MTs, the protein lacks definable secondary structural elements; however, the polypeptide fold is unique. The metal coordination and the cysteine spacing defines this unique fold. NcMT is only the second MT in the copper-bound form to be structurally characterized and the first containing the -CxCxxxxxCxC- motif. This motif is found in a variety of mammalian MTs and metalloregulatory proteins. The in vitro formation of the Cu(6)NcMT identical to the native Cu(6)NcMT was dependent upon the prior formation of the Zn(3)NcMT and its titration with Cu(I). The enhanced sensitivity and resolution of the 800 MHz (1)H-NMR spectral data permitted the 3D structure determination of the polypeptide backbone without the substitution and utilization of the NMR active spin 1/2 metals such as (113)Cd and (109)Ag. These restraints have been necessary to establish specific metal to cysteine restraints in 3D structural studies on this family of proteins when using lower field, less sensitive (1)H-NMR spectral data. The accuracy of the structure calculated without these constraints is, however, supported by the similarities of the 800 MHz structures of the alpha-domain of mouse MT1 compared to the one recalculated without metal-cysteine connectivities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,678

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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