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Enregistrement W1521623719 · doi:10.1111/j.1365-2958.2004.04029.x

Tryptophan recycling is responsible for the interferon‐γ resistance of <i>Chlamydia psittaci</i> GPIC in indoleamine dioxygenase‐expressing host cells

2004· article· en· W1521623719 sur OpenAlexaff
Heidi Wood, Christine Roshick, Grant McClarty

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCanadian Science Centre for Human and Animal HealthManitoba Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyOperonGeneIndoleamine 2,3-dioxygenaseTryptophan synthaseGeneticsMutanttrp operonTryptophanComplementationMolecular biologyEscherichia coliAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Comparative genomics indicates that vast differences in Chlamydia sp. host range and disease characteristics can be traced back to subtle variations in gene content within a region of the chromosome termed the plasticity zone. Genes required for tryptophan biosynthesis are located in the plasticity zone; however, the complement of genes encoded varies depending on the chlamydial species examined. Of the sequenced chlamydia genomes, Chlamydia psittaci GPIC contains the most complete tryptophan biosynthesis operon, encoding trpRDCFBA. Immediately downstream of the trp operon are genes encoding kynureninase and ribose phosphate pyrophosphokinase. Here, we show that, in GPIC, these genes are transcribed as a single transcript, the expression of which is regulated by tryptophan. Complementation analyses, using various mutant Escherichia coli isolates, indicate that the tryptophan biosynthesis, kynureninase and ribose phosphate pyrophosphokinase gene products are functional. Furthermore, growth of C. psittaci GPIC in HeLa cells, cultured in tryptophan-free medium, could be rescued by the addition of anthranilate, kynurenine or indole. In total, our results indicate that this complement of genes enables GPIC to recycle tryptophan and thus accounts for the interferon-gamma resistant phenotype displayed in indoleamine-2,3-dioxygenase-expressing host cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,900

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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