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Enregistrement W1522523006 · doi:10.1139/o09-185

Proteomic profile of primary isolated rat mesangial cells in high-glucose culture condition and decreased expression of PSMA6 in renal cortex of diabetic ratsThis paper is one of a selection of papers published in this special issue entitled “Second International Symposium on Recent Advances in Basic, Clinical, and Social Medicine” and has undergone the Journal's usual peer review process.

2010· article· en· W1522523006 sur OpenAlexaffvenue
Zhiguo Li, Haojun Zhang, Xi Dong, Frank J. Burczynski, Patrick C. Choy, Fang Yang, Hui Liu, Ping Li, Yuewen Gong

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Glycation End Products research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiabetic nephropathyWestern blotExtracellular matrixMesangial cellRenal cortexMolecular biologyProteomeProteomicsBiologyTwo-dimensional gel electrophoresisChemistryEndocrinologyInternal medicineDiabetes mellitusBiochemistryKidneyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diabetic nephropathy (DN) is one of the most important complications of diabetic patients and is characterized histologically by an accumulation of extracellular matrix (ECM) protein in the glomerular mesangium. Therefore, mesangial cells likely play an important role in the development of diabetic nephropathy. Here, we employed proteomic techniques to investigate the protein profile of rat mesangial cells under high-glucose culture conditions. Primary isolated rat glomerular mesangial cells were cultured under different concentrations of glucose (5.4 mmol.L-1 for normal control and 30 mmol.L-1 for high glucose) for 0, 8, 16, and 72 h, as well as for 25 days. Cellular total proteins were isolated from these cells and employed for two-dimensional gel electrophoresis (2-DE). Differentially expressed proteins were identified by matrix-assisted laser desorption - ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) and some of these proteins were documented in rat models of diabetes by Western blot. Rat mesangial cells were successfully isolated in the laboratory and their proliferation rates were significantly inhibited by high glucose. Two-dimensional gel electrophoresis analyses revealed 28 differentially expressed protein spots between the normal and high-glucose groups. After MALDI-TOF-MS analysis, all 28 protein spots were successfully identified with the peptide mass fingerprint (PMF) method. Representatively, SOD1, PCBP1 and PSMA6 were validated by Western blot analysis following protein extractions from the normal and high-glucose groups. Abundance of these proteins was consistent with that found in 2-DE. Moreover, expression of SOD1, PCBP1, and PSMA6 in renal cortex was further examined in two rat models of diabetes (streptozotocin-induced and spontaneous OLETF diabetic models). Abundance of SOD1 and PCBP1 proteins did not show any significant difference between normal control and diabetic rats. However, abundance of the PSMA6 protein was significantly reduced in the renal cortex of both STZ-induced and spontaneous OLETF diabetic rats. Proteomic analysis identified 28 differentially expressed proteins in primary isolated rat mesangial cells between normal and high glucose treatments. Expression of one identified protein was found to be consistent with expression in the renal cortex of two rat diabetic models. Therefore, identification of protein expression patterns in mesangial cells can be employed to develop a therapeutic target for treatment of diabetic nephropathy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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