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Enregistrement W1523558272 · doi:10.1111/j.1469-1809.2007.00350.x

Confidence intervals for candidate gene effects and environmental factors in population‐based association studies of families

2007· article· en· W1523558272 sur OpenAlexafffund
Janey Shin, Gerarda Darlington, Cecilia A. Cotton, Mary Corey, Shelley B. Bull

Notice bibliographique

RevueAnnals of Human Genetics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of GuelphEli Lilly (Canada)
Organismes subventionnairesDivision of Mathematical SciencesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésConfidence intervalCandidate genePopulationGeneticsBiologyAssociation (psychology)GeneDemographyStatisticsEnvironmental healthMedicinePsychologyMathematicsSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Complex diseases are influenced by both genetic and environmental factors. Studies of individuals or of families can be used to examine the association of genetic factors, such as candidate genes, and other risk factors with the presence or absence of complex disorders. If families are investigated, whether or not they are randomly ascertained, possible familial correlation among observations must be considered. We have compared two statistical approaches for analyzing correlated binary data from randomly ascertained nuclear families. The generalized estimating equations approach (GEE) can be used to adjust for familial correlation. The relationship between covariates and the response is modelled, and the correlations among family members are treated as nuisance parameters. For comparison, we have proposed two strategies from a hierarchical nonparametric bootstrap approach. One strategy (S1) samples family units, preserving the structure and correlation within each family. A second and novel strategy (S2) also samples family units but then randomly samples offspring with replacement in each family. We applied the methods to data from a study of cardiovascular disease, and followed up with a simulation study in which family data were generated from an underlying multifactorial genetic model. Although the bootstrap approach was more computationally demanding, it outperformed the GEE in terms of confidence interval coverage probabilities for all sample sizes considered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,102
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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