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Enregistrement W1523576534 · doi:10.1186/bcr1557

Phenotypic characterization of mouse mammary epithelial stem and progenitor cells

2006· article· en· W1523576534 sur OpenAlexaff
Julia Stingl, CJ Eaves, Christopher J.E. Watson

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensTerry Fox Research Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMedical Research CouncilJapan Society for the Promotion of ScienceCancer Research UKBreast Cancer CampaignBreast Cancer Research TrustCancer and Polio Research FundKing's College LondonUniversity of EssexUniversity of DundeeWellcome TrustUniversity of KentWorld Cancer Research FundCambridge University HospitalsUniversity of SheffieldRoyal College of Pathologists of Australasia
Mots-clésBiologyProgenitor cellPhenotypeHaematopoiesisStem cellCD31ProgenitorCD24Microarray analysis techniquesMicroarrayCancer researchCell biologyGene expressionCancer stem cellGeneGeneticsAngiogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Epidemiological studies have shown that only about 20% of the familial clustering of breast cancer is explained by the known highly penetrant mutations in BRCA1 and BCRA2.We have set out to search for the genes for the remaining 80%.Twin studies indicate a predominant role of shared genes rather than a shared environment; the patterns of occurrence of breast cancer in families are consistent with a major polygenic component.Methods We have assembled a population based set of 5,000 breast cancer cases and 5,000 controls from the East Anglian population.We have simple clinical and epidemiological information, including family history, and samples of blood and paraffin embedded tumour.We have used association studies based on single nucleotide polymorphisms, first with candidate genes and then in a genome-wide scan of 266,000 single nucleotide polymorphisms, to search for the putative predisposing genes.We have as yet searched only for common variants (frequency >5%). ResultsWe have modelled the effects of polygenic predisposition in the East Anglian population, and have shown that the model predicts a wide distribution of individual risk in the population, such that half of all breast cancers may occur in the 12% of women at greatest risk.Both the candidate gene-based and genome-wide scans have provided provisional identification of a number of novel susceptibility genes, and these are currently being confirmed by a world-wide consortium of independent laboratories totalling 20,000-plus cases and controls.No single gene so far identified contributes more than 2% of the total inherited component, consistent with a model in which susceptibility is the result of a large number of individually small genetic effects. S2 Translating breast cancer research into clinical practice -new approaches and better outcomes

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,087
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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