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Enregistrement W1523631507 · doi:10.1074/jbc.m115.642199

Determinants of Cation Permeation and Drug Sensitivity in Predicted Transmembrane Helix 9 and Adjoining Exofacial Re-entrant Loop 5 of Na+/H+ Exchanger NHE1

2015· article· en· W1523631507 sur OpenAlexafffund
Tushare Jinadasa, Colin B. Josephson, Annie Boucher, John Orlowski

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensFoothills Medical CentreUniversity of CalgaryMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCysteineChemistryTransmembrane domainMutantMutagenesisTransmembrane proteinSodium–hydrogen antiporterBiophysicsBiochemistryStereochemistryBiologyMembraneEnzymeGeneReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian Na(+)/H(+) exchangers (NHEs) regulate numerous physiological processes and are involved in the pathogenesis of several diseases, including tissue ischemia and reperfusion injuries, cardiac hypertrophy and failure, and cancer progression. Hence, NHEs are being targeted for pharmaceutical-based clinical therapies, but pertinent information regarding the structural elements involved in cation translocation and drug binding remains incomplete. Molecular manipulations of the prototypical NHE1 isoform have implicated several predicted membrane-spanning (M) helices, most notably M4, M9, and M11, as important determinants of cation permeation and drug sensitivity. Here, we have used substituted-cysteine accessibility mutagenesis and thiol-modifying methanethiosulfonate (MTS) reagents to further probe the involvement of evolutionarily conserved sites within M9 (residues 342-363) and the adjacent exofacial re-entrant loop 5 between M9 and M10 (EL5; residues 364-415) of a cysteine-less variant of rat NHE1 on its kinetic and pharmacological properties. MTS treatment significantly reduced the activity of mutants containing substitutions within M9 (H353C, S355C, and G356C) and EL5 (G403C and S405C). In the absence of MTS, mutants S355C, G403C, and S405C showed modest to significant decreases in their apparent affinities for Na(+) o and/or H(+) i. In addition, mutations Y370C and E395C within EL5, whereas failing to confer sensitivity to MTS, nevertheless, reduced the affinity for Na(+) o, but not for H(+) i. The Y370C mutant also exhibited higher affinity for ethylisopropylamiloride, a competitive antagonist of Na(+) o transport. Collectively, these results further implicate helix M9 and EL5 of NHE1 as important elements involved in cation transport and inhibitor sensitivity, which may inform rational drug design.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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