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Enregistrement W1524044318 · doi:10.1096/fasebj.21.5.a25

TDP‐43 in the ubiquitin pathology of frontotemporal dementia with VCP gene mutations

2007· article· en· W1524044318 sur OpenAlexaff
Mark S. Forman, Ian R. Mackenzie, Nigel J. Cairns, Philip J. Boyer, William R. Markesbery, Manuela Neumann

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFrontotemporal lobar degenerationUbiquitinFrontotemporal dementiaPathologyC9orf72Molecular pathologyDementiaMutationBiologyMedicineGeneGeneticsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Frontotemporal dementia with inclusion body myopathy and Paget's disease of bone (IBMPFD) is a rare, autosomal‐dominant disorder caused by mutations in the gene valosin‐containing protein (VCP). The CNS pathology is characterized by a novel pattern of ubiquitin pathology distinct from sporadic and familial frontotemporal lobar degeneration with ubiquitin‐positive inclusions (FTLD‐U) without VCP mutations. TAR DNA binding protein (TDP‐43) was recently identified as a major disease protein in the ubiquitin‐positive inclusions of sporadic and familial FTLD‐U. To determine if the ubiquitin pathology associated with mutations in VCP is characterized by the accumulation of TDP‐43, we analyzed TDP‐43 in the CNS pathology of five patients with VCP gene mutations. Accumulations of TDP‐43 co‐localized with ubiquitin pathology in IBMPFD including both the intranuclear inclusions and dystrophic neurites. Similar to FTLD‐U, phosphorylated TDP‐43 was detected only in insoluble brain extracts from affected brain regions. Identification of TDP‐43, but not VCP, within ubiquitin‐positive inclusions supports the hypothesis that VCP gene mutations lead to a dominant negative loss or alteration of VCP function culminating in impaired degradation of TDP‐43. TDP‐43 is a common pathologic substrate linking a variety of distinct patterns of FTLD‐U pathology caused by different genetic alterations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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