A volume‐exclusion normalization procedure for quantitative Raman confocal microspectroscopy of immersed samples applied to human embryonic stem cells
Notice bibliographique
Résumé
Raman microspectroscopy is a quantitative instrumental method with considerable promise for the nondestructive analysis of living biological samples. Amongst samples of particular interest are human embryonic stem cells because of their therapeutic potential and because examination using Raman microspectroscopy does not appear to adversely affect this potential. However, it can be difficult to compare different spectra obtained with this technique and to quantify the native cellular constituents of such samples because their characteristic dimensions are difficult to establish or may vary from point to point. We present here a method to normalize spectra and estimate sample thicknesses based on a reference component present in the basal cell culture medium when we perform spectroscopy on colonies of living cells. Because more basal medium is displaced from the sampling volume as the cell layer increases in thickness, and because this component is present in the medium but excluded from cells, a concomitant decline therefore occurs in the intensity of the Raman scattering from the reference component. This permits comparisons between samples because their spectra can be scaled in inverse relation to their excluded volumes. Furthermore, estimations of sample thicknesses can also be obtained based on the same concept. Thus, the absolute quantification of cellular components becomes possible because cell sample volumes can be determined. Although applied to human embryonic stem cells, the approach is sufficiently general to be adapted for use with other samples. Copyright © 2011 John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».