Fast computation of myelin maps from MRI T<sub>2</sub>relaxation data using multicore CPU and graphics card parallelization
Notice bibliographique
Résumé
PURPOSE: To develop a fast algorithm for computing myelin maps from multiecho T2 relaxation data using parallel computation with multicore CPUs and graphics processing units (GPUs). MATERIALS AND METHODS: Using an existing MATLAB (MathWorks, Natick, MA) implementation with basic (nonalgorithm-specific) parallelism as a guide, we developed a new version to perform the same computations but using C++ to optimize the hybrid utilization of multicore CPUs and GPUs, based on experimentation to determine which algorithmic components would benefit from CPU versus GPU parallelization. Using 32-echo T2 data of dimensions 256 × 256 × 7 from 17 multiple sclerosis patients and 18 healthy subjects, we compared the two methods in terms of speed, myelin values, and the ability to distinguish between the two patient groups using Student's t-tests. RESULTS: The new method was faster than the MATLAB implementation by 4.13 times for computing a single map and 14.36 times for batch-processing 10 scans. The two methods produced very similar myelin values, with small and explainable differences that did not impact the ability to distinguish the two patient groups. CONCLUSION: The proposed hybrid multicore approach represents a more efficient alternative to MATLAB, especially for large-scale batch processing.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».