Sensitivity comparison of two Food and Drug Administration–licensed, triplex nucleic acid test automated assays for hepatitis B virus DNA detection and associated projections of United States yield
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: There have been no comparisons of the relative sensitivity of the two Food and Drug Administration-licensed multiplex (MPX) nucleic acid test (NAT) systems (Procleix Ultrio [Gen-Probe], TIGRIS platform [Novartis]; and cobas TaqScreen MPX [Roche Molecular Systems], cobas s 201 platform [Roche Instrument Center]) for detecting hepatitis B virus (HBV)-infected donors in minipool sizes (MP) used in the United States. STUDY DESIGN AND METHODS: Routine blood samples from Thailand were obtained from plasma units from 129 hepatitis B surface antigen (HBsAg)-negative, HBV NAT-yield donations. Blinded US testing included antibody to hepatitis B core antigen (anti-HBc), NAT using both manufacturers' systems (undiluted-individual donation [ID], in singlet and diluted 1:6 and 1:16 in triplicate), quantitative antibody to hepatitis B surface antigen, HBV DNA viral loads, and HBV genotyping. HBV yields in the United States were estimated using the incidence/window period (WP) model and compared to the calculated assay sensitivities. RESULTS: Eighty samples were classified as occult HBV (anti-HBc reactive) and 49 as WP (anti-HBc nonreactive). For US pool sizes, MPX detected significantly more samples than Ultrio (MPX MP6 vs. Ultrio MP16; p < 0.0001 for occult and WP). Ultrio MP16 results were not statistically different from Ultrio MP6 (p = 0.68 for occult; p = 0.42 for WP). There was no difference between platforms for MP sizes used in most of the world (MPX MP6 vs. Ultrio ID; p = 0.70 for occult and p = 0.34 for WP). Viral loads were higher in WP samples. Modeled yield estimates were consistent with measured assay sensitivity on the Thai donor samples. CONCLUSIONS: As used in the United States, MPX MP6 is more sensitive than Ultrio MP16, but the impact of this difference is mitigated by low numbers of HBV WP infections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,015 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».