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Enregistrement W1526195898

Evaluation and Synthesis of Sugar 1-Phosphate Substrates for Nucleotidylyltransferases

2010· article· en· W1526195898 sur OpenAlexvenueno aff
Stephen A. Beaton

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSugar phosphatesSugarNucleotideSubstrate (aquarium)PhosphateChemistryGlycosyltransferaseNucleotide sugarBiochemistryEnzymePhosphonateStereochemistryBiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of many of glycosyltransferases is limited due to an inadequate access to sugar\nnucleotides. Preparation of sugar nucleotides through the use of nucleotidylyltransferases\nwith broad substrate specificities is gaining significant interest and offers high yields and\nstereospecificity. Physiologically, the glucose 1-phosphate thymidylyltransferase\ncatalyzes the condensation of ?-D-glucose 1-phosphate and deoxythymidine triphosphate\nto yield deoxythymidine diphospho glucose. Exploiting and targeting these enzymes also\nhas the potential of yielding new therapeutics.\nCps2L is a thymidylyltransferase isolated from Streptococcus pneumoniae, with\nbroad substrate flexibility. The substrate specificity of Cps2L was evaluated with new\nsugar 1-phosphate analogues to gain further insight into substrate and inhibitor\nrequirements. Several sugar 1-phosphate analogues including sugar 1C-phosphonates\n(and analogues thereof), 2-deoxy-2-fluorosugar 1-phosphates, and glucopyranose 1-\nboranophosphates have been used to probe the sugar 1-phosphate modification tolerance\nof Cps2L. In addition, NMR spectroscopy was used to determine the anomeric\nstereochemistry of 2-deoxy-2-fluorosugars nucleotide products. For those substrates that\nwere accepted by Cps2L, steady-state kinetic parameters were determined. The enzyme\nis able to almost equally form Michaelis complexes with different sugar substrates,\nwhereas the turnover values for obtaining the corresponding sugar nucleotide were\ndifferent. The evaluation of the substrate tolerance of Cps2L, as well as the synthesis of\n?-D-glucose-1C-thiophosphonate, a difluoro and a bisphosphono analogue of ?-D-glucose\n1C-phosphonate will be described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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