The Role of PIKfyve in the Neutrophil Innate Immune Response
Notice bibliographique
Résumé
Phosphoinositides are lipid signals that help control leukocyte function including phagocytosis, phagosome maturation and chemotaxis. For example, phosphatidylinositol‐3,5‐bisphosphate (PtdIns(3,5)P2), a lysosomal phosphoinositide, was recently shown to control phagosome maturation in macrophages. Here, we investigated the role of PtdIns(3,5)P2 in neutrophils. Neutrophils are the most abundant leukocyte and the first leukocyte involved in cell‐mediated immunity because of their proficiency in chemotaxis. Once at a site of infection, neutrophils release bactericidal molecules by degranulation, production of reactive oxygen species and phagocytosis of pathogens. Here, we pre‐treated neutrophils with apilimod, an inhibitor of PIKfyve, the kinase that synthesizes PtdIns(3,5)P2 and examined the effects on neutrophils. Overall, we observed that PIKfyve loss of function was highly detrimental to neutrophils. First, apilimod‐treated neutrophils led to lysosome‐vacuoation but not granule‐vacuolation. Second, PIKfyve inhibited cells showed reduced cell velocity and directionality towards an fMLP‐gradient. Third, apilimod treated cells showed an ~80% decrease in its phagocytosis of bacteria and a 75% decrease in phagosomes stained for lysosome markers. Lastly, neutrophils treated with apilimod showed a ~50% decrease in the production of superoxide, a reactive oxygen species produced by respiratory burst to kill bacteria. Currently, we are testing whether PIKfyve activity is necessary for activation of the Rac GTPase, which is essential for the above neutrophil functions. Indeed, preliminary results show that PIKfyve inhibited cells have reduced levels of Rac‐GTP bound.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».