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Enregistrement W1528963330 · doi:10.1212/wnl.82.10_supplement.p6.046

De Novo Deletion of AFG3L2 Causing Spinocerebellar Ataxia Type 28 in the Context of Multiple Genomic Anomalies (P6.046)

2014· article· en· W1528963330 sur OpenAlexaff
Kenneth A. Myers, Jodi Warman‐Chardon, Kym M. Boycott

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensCongress of Aboriginal PeoplesUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSpinocerebellar ataxiaContext (archaeology)AtaxiaMedicineGeneticsBiologyNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Present a case of spinocerebellar ataxia 28 (SCA28) secondary to de novo deletion of AFG3L2. BACKGROUND: SCA28 is one of the less common autosomal dominant progressive spinocerebellar ataxias. The clinical phenotype is juvenile-onset, slowly progressive ataxia with associated ophthalmoplegia and gaze-evoked nystagmus. The causative gene is AFG3L2, located at 18p11. Missense mutations of this gene have been the identified genetic abnormality in all individuals described thus far. DESIGN/METHODS: Comparative genomic hybridization microarray was used, along with standard genetic analysis techniques. RESULTS: 23 year old man with global developmental delay had continued to slowly acquire motor and language milestones until 13 years of age, when the onset of progressive neurologic deterioration, including ataxia and abnormal eye movements, was noted. MRI of the brain at 16 years of age showed mild cerebellar atrophy. Cytogenetic investigations demonstrated one full additional copy of the X chromosome with a full complement of the Y chromosome (Klinefelter syndrome) as a Y;18 translocation. In addition, a 5.3 MB deletion in the region 18p11.23-p11.21 including 33 RefSeq genes (including AFG3L2) and a 6.72 MB mosaic deletion in the region 18p11.32-p11.31 including 38 RefSeq genes were identified and were shown to reside on the translocated chromosome 18. In addition a 39 CAG repeat expansion in the HD gene at 4p16.3 (reduced penetrance Huntington disease) was identified. CONCLUSIONS: The neurologic deterioration is clinically consistent with the few previously described cases of SCA28 and, in this case, is presumed to be secondary to the heterozygous deletion of AFG3L2. This appears to be a de novo change, as there is no family history of ataxia, chromosome testing of both parents was normal, and the deletion likely happened in concert with the Y;18 translocation. This demonstrates a novel genetic mechanism for generation of the SCA28 phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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