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Enregistrement W1529899011 · doi:10.1002/9783527652969.ch8

Mechanism‐Based Screening Strategies for Anthelmintic Discovery

2012· other· en· W1529899011 sur OpenAlexaff
Timothy G. Geary

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typeother
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueHelminth infection and control
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMechanism (biology)AnthelminticDrug discoveryComputational biologyComputer scienceData scienceBiologyBioinformaticsZoologyEpistemologyPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Until the late 1980s, anthelmintic discovery relied on whole-organism-based approaches. Methods employing nematodes or flatworms in culture were not very successful in identifying new compounds; a prominent drawback of many such screens was the high proportion of false-positives (compounds active in culture, but not in infected animals). This factor, along with the almost complete adoption of mechanism-based approaches in all other pharmaceutical operations, led to the development and incorporation of such strategies for anthelmintic discovery. The lack of suitable functional genomics platforms for parasitic nematodes made the choice of novel targets for screening a difficult step, as validation prior to screening could only be done in surrogate organisms and only for drugs that were inhibitors or antagonists of parasite proteins. Although no new anthelmintics have yet emerged from mechanism-based screens, relatively few attempts have been made with this strategy and it remains compelling. This chapter summarizes some attempts at anthelmintic discovery through high-throughput, mechanism-based screens and discusses possible solutions to problems that remain to be resolved to improve the success rate of this strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,497
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0210,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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