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Enregistrement W1530082728 · doi:10.1002/stem.1436

Parallel assessment of globin lentiviral transfer in induced pluripotent stem cells and adult hematopoietic stem cells derived from the same transplanted β-thalassemia patient

2013· article· en· W1530082728 sur OpenAlexafffund
Alisa Tubsuwan, Soumeya Abed, Annette Deichmann, Melanie Kardel, Cynthia C. Bartholomä, Alice M.S. Cheung, Olivier Nègre, Zahra Kadri, Suthat Fucharoen, Christof von Kalle, Emmanuel Payen, Stany Chrétien, Manfred Schmidt, Connie J. Eaves, Philippe Leboulch

Notice bibliographique

RevueStem Cells · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésBiologyInduced pluripotent stem cellHaematopoiesisStem cellGlobinThalassemiaCell biologyGeneticsEmbryonic stem cellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A patient with β(E)/β(0) -thalassemia major was converted to transfusion-independence 4.5 years ago by lentiviral gene transfer in hematopoietic stem cells while showing a myeloid-biased cell clone. Induced pluripotent stem cells (iPSCs) are a potential alternative source of hematopoietic stem cells. If fetal to adult globin class, switching does not occur in vivo in iPSC-derived erythroid cells, β-globin gene transfer would be unnecessary. To investigate both vector integration skewing and the potential use of iPSCs for the treatment of thalassemia, we derived iPSCs from the thalassemia gene therapy patient and compared iPSC-derived hematopoietic cells to their natural isogenic somatic counterparts. In NSG immunodeficient mice, embryonic to fetal and a partial fetal to adult globin class switching were observed, indicating that the gene transfer is likely necessary for iPSC-based therapy of the β-hemoglobinopathies. Lentivector integration occurred in regions of low and high genotoxicity. Surprisingly, common integration sites (CIS) were identified across those iPSCs and cells retrieved from isogenic and nonisogenic gene therapy patients with β-thalassemia and adrenoleukodystrophy, respectively. This suggests that CIS observed in the absence of overt tumorigenesis result from nonrandom lentiviral integration rather than oncogenic in vivo selection. These findings bring the use of iPSCs closer to practicality and further clarify our interpretation of genome-wide lentivector integration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,034
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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