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Enregistrement W153245203 · doi:10.1096/fasebj.20.5.lb4-b

Combining protein complementation and resonance energy transfer assays to determine if three different proteins are part of the same G protein signaling complex in living cells

2006· article· en· W153245203 sur OpenAlexaff
R. Victor Rebois, Denis J. Dupré, Mélanie Robitaille, Terence E. Hébert

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityWilliam Osler Health System
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBimolecular fluorescence complementationHeterotrimeric G proteinFörster resonance energy transferYellow fluorescent proteinGreen fluorescent proteinProtein–protein interactionG proteinCell biologyComplementationProtein subunitFluorescenceChemistrySignal transductionBiophysicsBiologyMolecular biologyBiochemistryMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The N‐ and C‐terminal fragments of yellow fluorescent protein (YN and YC) expressed separately or together are not fluorescent. However, if YN and YC are brought together by fusing them to proteins that associate, a fluorescent protein can be reconstituted in a process called bimolecular fluorescence complementation (BiFC). If this fluorescent protein is close to (<10 nm) a luciferase (Luc) tagged protein, bioluminescence resonance energy transfer (BRET) occurs when the energy produced by Luc is transferred to the fluorescent protein in a process we call BiFC/BRET. G protein‐mediated signal transduction involves the interaction of a receptor, a heterotrimeric G protein and an effector. BiFC/BRET experiments were used to determine if three separate G protein signaling components are part of the same complex in vivo . BiFC occurred when various G protein β and γ subunits tagged, respectively, with YN and YC were co‐expressed and the BiFC was plasma membrane localized. BiFC was detected between tagged Gβ 1–4 and Gγ 2 , Gγ 3 , Gγ 7 and Gγ 11 . YN‐Gβ 1 and YC‐Gγ 2 subunits together acted as an acceptor in BiFC/BRET experiments when co‐expressed with either adenylyl cyclase or the Kir3.1 K + channel subunit tagged with Luc. BiFC/BRET was observed in the absence of a receptor agonist and these interactions were sensitive to receptor stimulation. These results demonstrate the feasibility of using BiFC to identify novel interacting proteins for Gβγ subunits, and of combining BiFC and BRET to demonstrate the simultaneous presence of three signaling proteins in a complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,491

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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