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Enregistrement W1532510695 · doi:10.1139/o08-133

Actin dynamics and functions in the interphase nucleus: moving toward an understanding of nuclear polymeric actinThis paper is one of a selection of papers published in this Special Issue, entitled 29th Annual International Asilomar Chromatin and Chromosomes Conference, and has undergone the Journal’s usual peer review process.

2009· review· en· W1532510695 sur OpenAlexaffvenue
Randall S. Gieni, Michael J. Hendzel

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2009
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleoplasmCell biologyChromatinActin remodelingMDia1BiologyCytoplasmActinNuclear transportCell nucleusActin cytoskeletonBiochemistryGeneCellCytoskeletonNucleolus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Actin exists as a dynamic equilibrium of monomers and polymers within the nucleus of living cells. It is utilized by the cell for many aspects of gene regulation, including mRNA processing, chromatin remodelling, and global gene expression. Polymeric actin is now specifically linked to transcription by RNA polymerase I, II, and III. An active process, requiring both actin polymers and myosin, appears to drive RNA polymerase I transcription, and is also implicated in long-range chromatin movement. This type of mechanism brings activated genes from separate chromosomal territories together, and then participates in their compartmentalization near nuclear speckles. Nuclear speckle formation requires polymeric actin, and factors promoting polymerization, such as profilin and PIP2, are concentrated there. A review of the literature shows that a functional population of G-actin cycles between the cytoplasm and the nucleoplasm. Its nuclear concentration is dependent on the cytoplasmic G-actin pool, as well as on the activity of import and export mechanisms and the availability of interactions that sequester it within the nucleus. The N-WASP-Arp2/3 actin polymer-nucleating mechanism functions in the nucleus, and its mediators, including NCK, PIP2, and Rac1, can be found in the nucleoplasm, where they likely influence the kinetics of polymer formation. The actin polymer species produced are tightly regulated, and may take on conformations not easily recognized by phalloidin. Many of the factors that cleave F-actin in the cytoplasm are present at high levels in the nucleoplasm, and are also likely to affect actin dynamics there. The absolute and relative G-actin content in the nucleoplasm and the cytoplasm of a cell contains information about the homeostatic state of that cell. We propose that the cycling of G-actin between the nucleus and cytoplasm represents a signal transduction mechanism that can function through both extremes of global cellular G-actin content. MAL signalling within the serum response factor pathway, when G-actin levels are low, represents a well-studied example of actin functioning in signal transduction. The translocation of NCK into the nucleus, along with G-actin, during dissolution of the cytoskeleton in response to DNA damage represents another instance of a unique signalling mechanism operating when G-actin levels are high.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,774
Score d'incertitude au seuil0,973

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations130
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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