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Enregistrement W1533064505 · doi:10.1111/j.1432-1033.2004.04338.x

Characterization of a cathepsin L‐associated protein in <i>Artemia</i> and its relationship to the FAS‐I family of cell adhesion proteins

2004· article· en· W1533064505 sur OpenAlexafffund
A.H. Warner, Ervin Pullumbi, Reinout Amons, Liqian Liu

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Biochemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Windsor
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDalhousie UniversityWayne State University
Mots-clésCathepsin OCathepsinCathepsin LMolecular biologyCathepsin ECathepsin ABiochemistryBiologycDNA libraryCathepsin HCathepsin BComplementary DNAPeptide sequenceProtein subunitBrine shrimpCathepsin DEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We reported previously that the major cysteine protease in embryos and larvae of the brine shrimp, Artemia franciscana, is a heterodimeric protein consisting of a catalytic subunit (28.5 kDa) with a high degree of homology with cathepsin L, and a noncatalytic subunit (31.5 kDa) of unknown function. In the study reported here the noncatalytic subunit, or cathepsin L-associated protein (CLAP), was separated from cathepsin L by chromatography on Mono S and found to contain multiple isoforms with pIs ranging from 5.9 to 6.1. Heterodimeric and monomeric cathepsin L showed similar activity between pH 5 and 6.5, while the heterodimer was about twice as active as monomeric cathepsin L below pH 5. The heterodimer was more stable than the monomer between pH 6 and 7.4 and at 30-50 degrees C. Artemia CLAP and cathepsin L are present in nearly equimolar amounts at all stages in the life cycle and most abundant in encysted eggs and embyros. Moreover, CLAP, either free or as a complex with cathepsin L, was resistant to hydrolysis by cathepsin L. Two clones coding for CLAP were isolated from an Artemia embryo cDNA library and sequenced. Both clones have nearly identical open reading frames, but show differences at the 5'- and 3'-termini. Each cDNA clone has an extensive 3'-untranslated region containing 70-72% A+T. The deduced amino acid sequence of CLAP cDNA revealed two domains which were very similar to domains in fasciclin I and other cell adhesion proteins. The nucleotide sequences of clones 1 and 2 have been entered into the NCBI database (AY307377 and AY462276). This study supports the view that the noncatalytic subunit of the heterodimeric cysteine protease in Artemia stabilizes cathepsin L at various pH and temperatures normally inconsistent with cathepsin L from other organisms, and that CLAP serves as a docking mechanism for cathepsin L at nonlysosomal sites in Artemia embryos.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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