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Enregistrement W1533693363 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.844.1

TEMPERATURE‐SENSITIVE, POST‐TRANSLATIONAL REGULATION OF PLANT OMEGA‐3 FATTY ACID DESATURASES IS MEDIATED BY THE ER‐ASSOCIATED DEGRADATION PATHWAY

2010· article· en· W1533693363 sur OpenAlexaff
Daiyuan Zhang, Jami B. O’Quin, Linda Bourassa, Spencer Foss, Jay Shocky, Satinder K. Gidda, Kent D. Chapman, Robert T. Mullen, John M. Dyer

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndoplasmic reticulumBiochemistryProtein degradationChemistryOmega 3 fatty acidFatty acidPolyunsaturated fatty acidArabidopsisAmino acidCell biologyBiologyGeneMutantDocosahexaenoic acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In plants, the endoplasmic reticulum (ER)‐localized omega‐3 fatty acid desaturases (Fad3s) increase the production of polyunsaturated fatty acids at cooler temperatures, but the FAD3 genes themselves are typically not upregulated during this adaptive response. Here, we expressed two closely related plant FAD3 genes in yeast cells and found that their enzymes produced significantly different amounts of omega‐3 fatty acids. Moreover, protein amounts were determined primarily by differences in rates of protein turnover, rather than mRNA levels, indicating that the Fad3 proteins are differentially regulated at the post‐translational level. Domain‐swapping and mutagenesis experiments revealed that each Fad3 protein contained a degradation signal in their N‐terminal region and that the charge density of a PEST‐like sequence within this region was largely responsible for the differences in their protein half‐lives. The half‐lives of both Fad3 proteins were increased at cooler temperatures and their protein degradation required Cdc48 adaptor proteins, Doa1 and Shp1, as well as proteasomal activity. Collectively, these findings indicate that the steady‐state amount of Fad3 proteins (and thus Fad3 activity) is modulated in response to temperature through a combination of cis ‐acting degradation signals and specific components of the ER‐associated degradation pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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