TEMPERATURE‐SENSITIVE, POST‐TRANSLATIONAL REGULATION OF PLANT OMEGA‐3 FATTY ACID DESATURASES IS MEDIATED BY THE ER‐ASSOCIATED DEGRADATION PATHWAY
Notice bibliographique
Résumé
In plants, the endoplasmic reticulum (ER)‐localized omega‐3 fatty acid desaturases (Fad3s) increase the production of polyunsaturated fatty acids at cooler temperatures, but the FAD3 genes themselves are typically not upregulated during this adaptive response. Here, we expressed two closely related plant FAD3 genes in yeast cells and found that their enzymes produced significantly different amounts of omega‐3 fatty acids. Moreover, protein amounts were determined primarily by differences in rates of protein turnover, rather than mRNA levels, indicating that the Fad3 proteins are differentially regulated at the post‐translational level. Domain‐swapping and mutagenesis experiments revealed that each Fad3 protein contained a degradation signal in their N‐terminal region and that the charge density of a PEST‐like sequence within this region was largely responsible for the differences in their protein half‐lives. The half‐lives of both Fad3 proteins were increased at cooler temperatures and their protein degradation required Cdc48 adaptor proteins, Doa1 and Shp1, as well as proteasomal activity. Collectively, these findings indicate that the steady‐state amount of Fad3 proteins (and thus Fad3 activity) is modulated in response to temperature through a combination of cis ‐acting degradation signals and specific components of the ER‐associated degradation pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».