The <scp>JR</scp> blood group system (<scp>ISBT</scp> 032): molecular characterization of three new null alleles
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Jr(a) (ISBT 901005) is a high-prevalence antigen unassigned to a blood group system. People lacking this antigen have been found in all populations studied but most commonly in Asians. Two recent reports established that ABCG2-null alleles encode the Jr(a-) phenotype and these studies provided the impetus to study other Jr(a-) individuals. STUDY DESIGN AND METHODS: Blood samples were part of our rare donor-patient collection. DNA was isolated and analyzed by standard techniques. RESULTS: In samples from 13 Jr(a-) study subjects, we found six alleles with nonsense nucleotide changes, three (c.784T, c.1591T, and c.337T) were novel. Twelve of the samples were homozygous for nonsense single-nucleotide polymorphisms (SNPs): eight were c.376T, two were c.706T, one was c.784T, and one was c.1591T. Each of these alleles predicts a truncated ABCG2 product, Gln126Stop, Arg236Stop, Gly262Stop, and Gln531Stop, respectively. One study subject was heterozygous for two nonsense SNPs: c.337C/T (Arg113Stop) and c.736C/T (Arg246Stop). CONCLUSIONS: Jr(a) is the sole antigen in the newly established JR blood group system (ISBT 032001). The previous ISBT designation (901005) is now obsolete. Since ABCG2null alleles define the Jr(a-) phenotype, an explanation for why no antithetical low-prevalence antigen to Jr(a) has been found, and also why anti-Jr(a) made by people with any of these JRnull alleles are mutually compatible has been determined. Based on our findings DNA-based genotyping can be developed to replace the serologic methods that are currently used to identify Jr(a-) blood donors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».