Transmembrane Helix 11 Is a Genuine Regulator of the Endoplasmic Reticulum Ca2+ Pump and Acts as a Functional Parallel of β-Subunit on α-Na+,K+-ATPase
Notice bibliographique
Résumé
The housekeeping sarco(endo)plasmic reticulum Ca(2+) ATPase SERCA2b transports Ca(2+) across the endoplasmic reticulum membrane maintaining a vital Ca(2+) gradient. Compared with the muscle-specific isoforms SERCA2a and SERCA1a, SERCA2b houses an 11th transmembrane segment (TM11) and a short luminal extension (LE) at its C terminus (2b-tail). The 2b-tail imposes a 2-fold higher apparent Ca(2+) affinity and lower V(max). Previously, we assumed that LE is the sole functional region of the 2b-tail and that TM11 is a passive element providing an additional membrane passage. However, here we show that peptides corresponding to the TM11 region specifically modulate the activity of the homologous SERCA1a in co-reconstituted proteoliposomes and mimic the 2b-tail effect (i.e. lower V(max) and higher Ca(2+) affinity). Using truncated 2b-tail variants we document that TM11 regulates SERCA1a independently from LE, confirming that TM11 is a second, previously unrecognized functional region of the 2b-tail. A phylogenetic analysis further indicates that TM11 is the oldest and most conserved feature of the 2b-tail, found in the SERCA pump of all Bilateria, whereas LE is only present in Nematoda and vertebrates. Considering remarkable similarities with the Na(+),K(+)-ATPase α-β interaction, we now propose a model for interaction of TM11 with TM7 and TM10 in the anchoring subdomain of the Ca(2+) pump. This model involves a TM11-induced helix bending of TM7. In conclusion, more than just a passive structural feature, TM11 acts as a genuine regulator of Ca(2+) transport through interaction with the pump.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».