Tumour necrosis factor alpha and interferon gamma induce transcriptional downregulation of aquaporin 3 RNA expression through distinct mechanisms (893.28)
Notice bibliographique
Résumé
Although aquaporins (AQP) are known to be involved in water movement, the role of AQP3 in the barrier dysfunction that characterizes inflammatory bowel diseases remains unknown. We hypothesized that TNFα and IFNγ were involved in the transcriptional inhibition of AQP3 RNA expression in intestinal inflammation. Methods: AQP3 expression was assessed in C57Bl/6 mice administered dextran sodium sulfate (DSS) to induce colonic inflammation. In vitro , the human adenocarcinoma cell line HT29 was treated with either TNFα or IFNγ and AQP3 pre‐mRNA and mRNA expression were assessed by real‐time RT‐PCR. Cytokine‐responsive transcriptional elements were elucidated using AQP3 promoter driven firefly luciferase expression. Results: AQP3 was decreased early in DSS colitis, with diminished basolateral membrane staining in epithelial cells lining colonic crypts. Similarly, TNFα or IFNγ‐treated HT29 cells had decreased AQP3 pre‐mRNA expression at 2 hr, followed by decreased mRNA expression at 6‐12 hr. IFNγ‐induced transcriptional inhibition of AQP3 expression was reversed using a broad‐spectrum JAK inhibitor (JAK Inhibitor I, 10 µM), but not a JAK2 specific inhibitor (JAK2 Inhibitor II, 10 µM). Truncated AQP3 promoter constructs revealed an IFNγ‐responsive transcriptional element in the 251bp region upstream of the TATA box and a transcriptional suppressor in the 251 ‐ 666bp region upstream of the TATA box. In contrast, TNFα‐induced transcriptional inhibition of AQP3 expression was not reversed by inhibitors of the PI3K, AKT, NF‐κB, ERK/MAPK and p38 MAPK pathways (LY294002, 10 µM; Triciribine, 1 µM; BAY11‐7082, 30 µM; U0126, 10 µM and SB203580, 10 µM respectively). Grant Funding Source : CCFC, CIHR & AIHS
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».