The rat ortholog of the presumptive flounder antifreeze enhancer‐binding protein is a helicase domain‐containing protein
Notice bibliographique
Résumé
The expression of winter flounder liver-type antifreeze protein (wflAFP) genes is tissue-specific and under seasonal and hormonal regulation. The only intron of the major wflAFP gene was demonstrated to be a liver-specific enhancer in both mammalian cell lines and flounder hepatocytes. Element B, the core enhancer sequence, was shown to interact specifically with a liver-enriched transcription factor, CCAAT/enhancer-binding protein alpha (C/EBPalpha), as well as a presumptive antifreeze enhancer-binding protein (AEP). In this study, the identity of the rat AEP ortholog was revealed via its DNA-protein interaction with element B. It is a helicase-domain-containing protein, 988 amino acids in length, and is homologous to mouse Smubp-2, hamster Rip-1 and human Smubp-2. The specific binding between element B and AEP was confirmed by South-Western analysis and gel retardation assays. Residues in element B important to this interaction were identified by methylation interference assays. Mutation on one of the residues disrupted the binding between element B and AEP and its enhancer activity was significantly reduced, suggesting that AEP is essential for the transactivation of the wflAFP gene intron. The rat AEP is ubiquitously expressed in various tissues, and the flounder homolog is present as shown by genomic Southern analysis. The potential role of AEP in regulating the flounder AFP gene expression is discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».