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Enregistrement W1538159564 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.1158.8

Skeletal muscle proteomic signature in pulmonary arterial hypertension (1158.8)

2014· article· en· W1538159564 sur OpenAlexaff
Aude Pflieger, François Potus, Simon Malenfant, Sandra Breuils‐Bonnet, Sébastien Bonnet, Steeve Provencher

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePulmonary Hypertension Research and Treatments
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSkeletal musclePulmonary hypertensionCitrate synthaseInternal medicineVentricleMuscle hypertrophyEndocrinologyMyogenesisMedicineOxidative phosphorylationPathologyCardiologyBiologyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Pulmonary arterial hypertension (PAH) is characterized by a progressive increase in pulmonary vascular resistance leading to right ventricular (RV) hypertrophy and ultimately failure. Numerous observations suggest that exercise limitation in pulmonary arterial hypertension (PAH) is not solely due to cardio‐pulmonary impairment, but that other determinants such as skeletal muscle abnormalities are involved. To better understand the exercise limitation origins in PAH, we studied the proteomic signature of skeletal muscle impairment in idiopathic PAH (iPAH) patients. Methods and results: Muscle proteins from 4 iPAH patients and 4 sex and age matched controls were extracted following quadriceps muscle biopsy. Fractioned peptides were then tagged using isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation (iTRAQ, ABsciex) specific for each patient. Tagged peptides were then mixed, fractioned, identified and quantified using mass spectrometry quantitative method. Over 900 proteins were identified, among them, 9 were under‐expressed and 7 were over‐expressed in all iPAH patient quadriceps. More than 75% of the under‐expressed proteins are involved in oxidative metabolism and most other highlighted proteins play a role in myogenesis. These findings were structurally associated with decreased mitochondrial density (citrate synthase assay) and impaired mitochondrial structure measured by electronic microscopy, while muscle fibers distribution was unchanged. Functionally, all these abnormalities resulted in decreases in oxidative metabolism (pyruvate dehydrogenases assay). Conclusions: For the first time in humans, we provide evidences that, as in lungs and the right ventricle, the impaired mitochondrial metabolism is also present in skeletal muscle suggesting that PAH might be considered as a global mitochondrial/metabolic disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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