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Enregistrement W1538404780 · doi:10.1074/jbc.m115.652396

Molecular Determinants of Calpain-dependent Cleavage of Junctophilin-2 Protein in Cardiomyocytes

2015· article· en· W1538404780 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCalpain Protease Function and Regulation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésCleavage (geology)CalpainCell biologyChemistryBiochemistryBiologyBiophysicsComputational biologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Junctophilin-2 (JP2), a membrane-binding protein that provides a structural bridge between the plasmalemma and sarcoplasmic reticulum, is essential for precise Ca(2+)-induced Ca(2+) release during excitation-contraction coupling in cardiomyocytes. In animal and human failing hearts, expression of JP2 is decreased markedly, but the molecular mechanisms underlying JP2 down-regulation remain incompletely defined. In mouse hearts, ischemia/reperfusion injury resulted in acute JP2 down-regulation, which was attenuated by pretreatment with the calpain inhibitor MDL-28170 or by transgenic overexpression of calpastatin, an endogenous calpain inhibitor. Using a combination of computational analysis to predict calpain cleavage sites and in vitro calpain proteolysis reactions, we identified four putative calpain cleavage sites within JP2 with three N-terminal and one C-terminal cleavage sites. Mutagenesis defined the C-terminal region of JP2 as the predominant calpain cleavage site. Exogenous expression of putative JP2 cleavage fragments was not sufficient to rescue Ca(2+) handling in JP2-deficient cardiomyocytes, indicating that cleaved JP2 is non-functional for normal Ca(2+)-induced Ca(2+) release. These data provide new molecular insights into the posttranslational regulatory mechanisms of JP2 in cardiac diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,347

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle