Molecular interactions regulating RIG‐I signaling to the innate antiviral response
Notice bibliographique
Résumé
Cytosolic sensing of incoming RNA virus infection is recognized by the DExD/H box RNA helicases RIG‐I and Mda5. The mitochondrial adaptor MAVS links sensing of viral RNA by RIG‐I/Mda5 to downstream signaling, resulting in the induction of pro‐inflammatory and antiviral genes by NF‐ κB and IRF respectively. We have demonstrated that NEMO, the adaptor of the IKK complex, induces activation of IRF3/7, acting downstream of RIG‐I and MAVS but upstream of TBK1/IKKε. NEMO requires TANK adaptor to mediate recruitment of the kinases and phosphorylation of IRF3/7. Thus, NEMO bridges the NF‐κB and IRF components of RIG‐I with the formation of a multimeric kinase complex. Ubiquitination plays a central role in regulating the activity of the RIG‐I pathway. MAVS undergoes K63 ubiquitination at a single Ser500 residue, adjacent to the MAVS transmembrane domain and a TRAF interacting motif (TIM). K63‐linked ubiquitination of MAVS mediates recruitment of IKKε, but not TBK1, to the mitochondrial compartment. Recruitment of TRAF3 to the C‐terminal TIM motif of MAVS is sterically hindered by IKKε, but is relieved by mutation of K500. Interestingly, the MAVS K500R mutant did not affect IFN gene activation, but rather appears to alter processing of NF‐κB2p100 in the non‐canonical NF‐κB pathway. Thus, MAVS ubiquitination provides another level at which to regulate the RIG‐I response to virus infection. This research was supported by grants from CIHR and NCIC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».