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Enregistrement W1541047239 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.672.39

Molecular interactions regulating RIG‐I signaling to the innate antiviral response

2008· article· en· W1541047239 sur OpenAlexafffund
John Hiscott, Suzanne Paz, Myriam Vilasco, Meztli Arguello, Judith Lacoste, Tiejun Zhao, Éliane Meurs, Rongtuan Lin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSignal transducing adaptor proteinRIG-ICell biologyIRF3MDA5UbiquitinRNA Helicase APhosphorylationBiologyTRIFIκB kinaseSignal transductionHelicaseRNARNA interferenceInnate immune systemNF-κBTranscription factorGeneBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytosolic sensing of incoming RNA virus infection is recognized by the DExD/H box RNA helicases RIG‐I and Mda5. The mitochondrial adaptor MAVS links sensing of viral RNA by RIG‐I/Mda5 to downstream signaling, resulting in the induction of pro‐inflammatory and antiviral genes by NF‐ κB and IRF respectively. We have demonstrated that NEMO, the adaptor of the IKK complex, induces activation of IRF3/7, acting downstream of RIG‐I and MAVS but upstream of TBK1/IKKε. NEMO requires TANK adaptor to mediate recruitment of the kinases and phosphorylation of IRF3/7. Thus, NEMO bridges the NF‐κB and IRF components of RIG‐I with the formation of a multimeric kinase complex. Ubiquitination plays a central role in regulating the activity of the RIG‐I pathway. MAVS undergoes K63 ubiquitination at a single Ser500 residue, adjacent to the MAVS transmembrane domain and a TRAF interacting motif (TIM). K63‐linked ubiquitination of MAVS mediates recruitment of IKKε, but not TBK1, to the mitochondrial compartment. Recruitment of TRAF3 to the C‐terminal TIM motif of MAVS is sterically hindered by IKKε, but is relieved by mutation of K500. Interestingly, the MAVS K500R mutant did not affect IFN gene activation, but rather appears to alter processing of NF‐κB2p100 in the non‐canonical NF‐κB pathway. Thus, MAVS ubiquitination provides another level at which to regulate the RIG‐I response to virus infection. This research was supported by grants from CIHR and NCIC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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