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Enregistrement W1542819714 · doi:10.1002/gepi.21911

Approximate score‐based testing with application to multivariate trait association analysis

2015· article· en· W1542819714 sur OpenAlex
Zhiyuan Xu, Wei Pan

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenetic Epidemiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute on Drug AbuseCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute on AgingNational Institutes of HealthNorthern California Institute for Research and EducationNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésScoreScore testMultivariate statisticsStatisticsMathematicsUnavailabilitySupport vector machineCovariance matrixKernel (algebra)Kernel methodQuantitative trait locusComputer scienceStatistical hypothesis testingArtificial intelligenceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For genome-wide association studies and DNA sequencing studies, several powerful score-based tests, such as kernel machine regression and sum of powered score tests, have been proposed in the last few years. However, extensions of these score-based tests to more complex models, such as mixed-effects models for analysis of multiple and correlated traits, have been hindered by the unavailability of the score vector, due to either no output from statistical software or no closed-form solution at all. We propose a simple and general method to asymptotically approximate the score vector based on an asymptotically normal and consistent estimate of a parameter vector to be tested and its (consistent) covariance matrix. The proposed method is applicable to both maximum-likelihood estimation and estimating function-based approaches. We use the derived approximate score vector to extend several score-based tests to mixed-effects models. We demonstrate the feasibility and possible power gains of these tests in association analysis of multiple and correlated quantitative or binary traits with both real and simulated data. The proposed method is easy to implement with a wide applicability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,300
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle