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Enregistrement W1543593033 · doi:10.1111/j.1600-0854.2012.01394.x

Dissection of Minimal Sequence Requirements for Rhoptry Membrane Targeting in the Malaria Parasite

2012· article· en· W1543593033 sur OpenAlex
Ana Cabrera, Susann Herrmann, Dominik Warszta, Joana Santos, Arun T. John Peter, Maya Kono, Sandra Debrouver, Thomas Jacobs, Tobias Spielmann, Christian Ungermann, Dominique Soldati‐Favre, Tim‐Wolf Gilberger

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesUniversité de GenèveMcMaster UniversityCanadian Institutes of Health ResearchHamilton Health Sciences
Mots-clésRhoptryBiologyMyristoylationCell biologyMembrane proteinBiogenesisOrganelleProtein targetingPeptide sequencePalmitoylationDense granulePlasmodium falciparumApicomplexaBiochemistryToxoplasma gondiiGeneticsMembraneGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rhoptries are specialized secretory organelles characteristic of single cell organisms belonging to the clade Apicomplexa. These organelles play a key role in the invasion process of host cells by accumulating and subsequently secreting an unknown number of proteins mediating host cell entry. Despite their essential role, little is known about their biogenesis, components and targeting determinants. Here, we report on a conserved apicomplexan protein termed Armadillo Repeats-Only (ARO) protein that we localized to the cytosolic face of Plasmodium falciparum and Toxoplasma gondii rhoptries. We show that the first 20 N-terminal amino acids are sufficient for rhoptry membrane targeting. This protein relies on both - myristoylation and palmitoylation motifs - for membrane attachment. Although these lipid modifications are essential, they are not sufficient to direct ARO to the rhoptry membranes. Mutational analysis revealed additional residues within the first 20 amino acids of ARO that play an important role for rhoptry membrane attachment: the positively charged residues R9 and K14. Interestingly, the exchange of R9 with a negative charge entirely abolishes membrane attachment, whereas the exchange of K14 (and to a lesser extent K16) alters only its membrane specificity. Additionally, 17 proteins predicted to be myristoylated and palmitoylated in the first 20 N-terminal amino acids were identified in the genome of the malaria parasite. While most of the corresponding GFP fusion proteins were trafficked to the parasite plasma membrane, two were sorted to the apical organelles. Interestingly, these proteins have a similar motif identified for ARO.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,524
Score d'incertitude au seuil0,265

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,341
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle