Human papillomavirus DNA prevalence and type distribution in anal carcinomas worldwide
Notice bibliographique
Résumé
Knowledge about human papillomaviruses (HPV) types involved in anal cancers in some world regions is scanty. Here, we describe the HPV DNA prevalence and type distribution in a series of invasive anal cancers and anal intraepithelial neoplasias (AIN) grades 2/3 from 24 countries. We analyzed 43 AIN 2/3 cases and 496 anal cancers diagnosed from 1986 to 2011. After histopathological evaluation of formalin-fixed paraffin-embedded samples, HPV DNA detection and genotyping was performed using SPF-10/DEIA/LiPA25 system (version 1). A subset of 116 cancers was further tested for p16(INK4a) expression, a cellular surrogate marker for HPV-associated transformation. Prevalence ratios were estimated using multivariate Poisson regression with robust variance in the anal cancer data set. HPV DNA was detected in 88.3% of anal cancers (95% confidence interval [CI]: 85.1-91.0%) and in 95.3% of AIN 2/3 (95% CI: 84.2-99.4%). Among cancers, the highest prevalence was observed in warty-basaloid subtype of squamous cell carcinomas, in younger patients and in North American geographical region. There were no statistically significant differences in prevalence by gender. HPV16 was the most frequent HPV type detected in both cancers (80.7%) and AIN 2/3 lesions (75.4%). HPV18 was the second most common type in invasive cancers (3.6%). p16(INK4a) overexpression was found in 95% of HPV DNA-positive anal cancers. In view of the results of HPV DNA and high proportion of p16(INK4a) overexpression, infection by HPV is most likely to be a necessary cause for anal cancers in both men and women. The large contribution of HPV16 reinforces the potential impact of HPV vaccines in the prevention of these lesions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».