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Enregistrement W1544584205 · doi:10.1158/1538-7445.am2014-2510

Abstract 2510: A porphodimethene chemical inhibitor of uroporphyrinogen decarboxylase

2014· article· en· W1544584205 sur OpenAlexaff
Kenneth W. Yip, Zhan Zhang, Noriko Sakemura-Nakatsugawa, Jui‐Wen Huang, Shi‐Jun Yue, Yulia Jitkova, Terence To, E.F. Pai, Aaron D. Schimmer, Jonathan F. Lovell, Jonathan L. Sessler, Fei‐Fei Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryViability assayStereochemistryCancer cellCisplatinBiochemistryCancerCancer researchApoptosisBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Uroporphyrinogen decarboxylase (UROD), a heme biosynthetic pathway enzyme that converts uroporphyrinogen to coproporphyrinogen, was recently identified as a potential anticancer target. UROD inhibition leads to an increase in reactive oxygen species (ROS), likely mediated by the Fenton reaction, which decreases cancer cell viability and sensitizes cells to cisplatin and radiation. Because there is no known chemical UROD inhibitor suitable for translational research, we aimed to design, synthesize, and characterize such a compound. In silico design and docking was used to identify a potential porphyrin analogue. Subsequent synthesis produced a porphodimethene (named PI-16) that inhibited UROD in an enzymatic assay (IC50 = 9.9 µM). PI-16 did not affect porphobilinogen deaminase (at 62.5 µM), thereby exhibiting some specificity. In cellular assays, PI-16 reduced FaDu and ME-180 cancer cell viability with half maximal effective concentrations of 22.7 µM and 26.9 µM, respectively, whereas normal oral epithelial (NOE) cells were only minimally affected. PI-16 combined effectively with cisplatin and radiation, with potent synergy being observed with cisplatin (Chou-Talalay combination index < 1). This work presents the first known synthetic UROD inhibitor, and sets the foundation for the design, synthesis, and characterization of higher affinity and more effective compounds. Citation Format: Kenneth W. Yip, Zhan Zhang, Noriko Sakemura-Nakatsugawa, Jui-Wen Huang, Shijun Yue, Yulia Jitkova, Terence To, Emil Pai, Aaron Schimmer, Jonathan Lovell, Jonathan Sessler, Fei-Fei Liu. A porphodimethene chemical inhibitor of uroporphyrinogen decarboxylase. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2510. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2510

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,501

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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