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Enregistrement W1544744127 · doi:10.4049/jimmunol.165.5.2518

Two Clusters of Acidic Amino Acids Near the NH2 Terminus of Complement Component C4 α′-Chain Are Important for C2 Binding

2000· article· en· W1544744127 sur OpenAlexaff
Qun Pan, Roger O. Ebanks, David E. Isenman

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeptideChemistryBinding siteStructural similarityPeptide sequenceBiochemistryComplement factor IStereochemistryMutagenesisComplement systemBiologyMutationAntibodyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous work has indicated a role for the NH2-terminal segment of the C3 alpha'-chain in the binding interactions of C3b with a number of its protein ligands. In particular, we have identified two clusters of acidic residues, namely, E736 and E737 and to a lesser extent D730 and E731, as being important in the binding of C3b to factor B and complement receptor 1 and the binding of iC3b to complement receptor 3. Whereas human C3 and C4 have an overall sequence identity of 29%, over a segment near the NH2 termini of their respective alpha'-chains the sequence identity is 56% (70% chemical similarity). Given the functional similarity between the C4b-C2 and C3b-B interactions in the respective formation of the classical and alternative pathway C3 convertases, as well as the sequence conservation of two acidic clusters, we hypothesized that residues 744EED and 749DEDD within the NH2-terminal segment of the C4 alpha'-chain would mediate in part the binding of C2 to C4b. We tested this hypothesis using three independent approaches. Site-directed mutagenesis experiments revealed that replacing subsets of the charged residues by their isosteric amides within either acidic cluster resulted in molecules having reduced C2 binding activity. Moreover, a synthetic peptide (C4 residues 740-756) encompassing the two acidic clusters was a specific inhibitor of the binding of C2 to red cell-associated C4b. Finally, Ab raised against the above peptide was able to block the interaction between red cell-associated C4b and fluid phase C2. Taken together, these results strongly suggest that the NH2-terminal acidic residue-rich segment of C4 alpha'-chain contributes importantly to the interaction of C4b with C2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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