The impact of Pleistocene climate change on an ancient arctic–alpine plant: multiple lineages of disparate history in <i>Oxyria digyna</i>
Notice bibliographique
Résumé
The ranges of arctic-alpine species have shifted extensively with Pleistocene climate changes and glaciations. Using sequence data from the trnH-psbA and trnT-trnL chloroplast DNA spacer regions, we investigated the phylogeography of the widespread, ancient (>3 million years) arctic-alpine plant Oxyria digyna (Polygonaceae). We identified 45 haplotypes and six highly divergent major lineages; estimated ages of these lineages (time to most recent common ancestor, T(MRCA)) ranged from ∼0.5 to 2.5 million years. One lineage is widespread in the arctic, a second is restricted to the southern Rocky Mountains of the western United States, and a third was found only in the Himalayan and Altai regions of Asia. Three other lineages are widespread in western North America, where they overlap extensively. The high genetic diversity and the presence of divergent major cpDNA lineages within Oxyria digyna reflect its age and suggest that it was widespread during much of its history. The distributions of individual lineages indicate repeated spread of Oxyria digyna through North America over multiple glacial cycles. During the Last Glacial Maximum it persisted in multiple refugia in western North America, including Beringia, south of the continental ice, and within the northern limits of the Cordilleran ice sheet. Our data contribute to a growing body of evidence that arctic-alpine species have migrated from different source regions over multiple glacial cycles and that cryptic refugia contributed to persistence through the Last Glacial Maximum.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».