MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1546013660 · doi:10.1034/j.1600-0854.2000.011208.x

Trafficking and Folding Defects in Hereditary Spherocytosis Mutants of the Human Red Cell Anion Exchanger

2000· article· en· W1546013660 sur OpenAlexafffund
Janne A. Quilty, Reinhart A.F. Reithmeier

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHereditary spherocytosisBiologyCell biologyMutantBand 3Anion exchangerFolding (DSP implementation)MutationProtein foldingIon exchangeMembrane proteinGeneticsIonMembraneGeneChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hereditary spherocytosis (HS) is a common inherited hemolytic anemia caused by mutations in erythrocyte proteins including the anion exchanger, AE1 (band 3). This study examined seven missense mutations (L707P, R760Q, R760W, R808C, H834P, T837M, and R870W) located in the membrane domain of the human AE1 that are associated with this disease. The HS mutants, constructed in full-length AE1 cDNA, could be transiently expressed to similar levels in HEK 293 cells. Immunofluorescence, cell surface biotinylation, and pulse chase labeling showed that the HS mutants all exhibited defective cellular trafficking from the endoplasmic reticulum to the plasma membrane. Impaired binding to an inhibitor affinity matrix indicated that the mutant proteins had non-native structures and may be misfolded. Further characterization of the HS R760Q mutant showed no change in its oligomeric structure or turnover (half-life = 15 h) compared to wild-type AE1, suggesting the mutant was not aggregated or targeted for rapid degradation via the proteasome. Intracellular retention of HS mutant AE1 would lead to destruction of the protein during erythroid development and would account for the lack of HS mutant AE1 in the plasma membrane of the mature red cell.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueTrafficMême sujetErythrocyte Function and PathophysiologyTravaux en français237 207