The Salmonella Pathogenicity Island-1 and -2 Encoded Type III Secretion Systems
Notice bibliographique
Résumé
Salmonella -A Diversified Superbug 470 gastroenteritis in many different host species.S. Typhimurium and S. Enteritidis are the most well-known examples and are able to cause different disease outcomes in various host species (Barrow, 2007, Boyle, et al., 2007, Lax, et al., 1995, Spreng, et al., 2006, Zhang & Mosser, 2008).S. Typhimurium and S. Enteritidis are able to induce a systemic infection in mice, young calves, chicks, and piglets.However, they are also able to colonize poultry and adult cattle without symptoms (Barrow, 2007, Boyle, et al., 2007, Lax, et al., 1995, Spreng, et al., 2006, Zhang & Mosser, 2008).In humans, infection with either of these serovars results in a self-limiting gastroenteritis (salmonellosis) involving fever, diarrhea, and abdominal pain.In rare cases, typically in the very young or immunocompromised, the infection can become systemic and lead to hospitalization and even death.A very small proportion of humans with salmonellosis can develop reactive arthritis (previously referred to as Reiter's syndrome), which is initially characterized by joint pain, eye irritation, and pain during urination (Boyle, et al., 2007, Cogan & Humphrey, 2003, Townes, 2010). Human disease, animal reservoirs, and modes of transmissionInfections by S. enterica are one of the most common causes of bacterial food-borne gastroenteritis (food poisoning) in the world, along with E. coli and Campylobacter infections (WHO, 2007).Of the S. enterica serovars, S. Enteritidis and S. Typhimurium are the leading cause of salmonellosis in humans in most countries.S. Enteritidis and S. Typhimurium are passed to humans primarily via consumption of contaminated poultry meat, water, and eggs.S. Enteritidis is more often associated with salmonellosis acquired from eggs, as it has a greater tendency to colonize eggs and reproductive organs of poultry than S. Typhimurium (Gantois, et al., 2008).Because chickens mostly do not show symptoms of disease, entire flocks can become colonized quite quickly and shed bacteria in their feces for extended periods of time (Catarame, et al., 2005, Clavijo, et al., 2006, Penha Filho, et al., 2009, Van Immerseel, et al., 2005).Loss of consumer confidence in products because of Salmonella contamination can result in substantial economic loss to the poultry industry.Additionally, human cases of salmonellosis place a significant burden on the health care system (Boyle, et al., 2007).There are approximately 1.4 million cases of salmonellosis per year resulting in about 15,000 hospitalizations and 400 deaths per year in the United States of America (USA) (USDA-ERS, 2009).Around 95% of these cases are caused by consumption of contaminated food products, and S. Enteritidis is responsible for at least 15% of these cases.S. Enteritidis is the second most commonly isolated serovar in North America after S. Typhimurium, while S. Enteritidis is number one in the European Union (EU) (Barrow, 2007, Callaway, et al.,
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,016 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».