Abstract 2864: RPS4X, a new prognostic and predictive biomarker of ovarian and breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Epithelial ovarian cancer (EOC) is a disease responsible for more cancer deaths among women in the Western world than all other gynecologic malignancies and breast cancer is leading cause of cancer death among the women worldwide. A major problem with such cancers is chemoresistance; hence the need to identify predictive biomarkers. Interestingly, overexpression of YB-1 in ovarian and breast cancer cells induces cisplatin resistance. Platinum coumpounds like cisplatin is often used in the treatments of these cancers. Y box-binding protein 1 (YB-1) is a multifunctional protein that affects transcription, splicing and translation of mRNA. In this study, we used a tagged YB-1 construct to identify by mass spectrometry the proteins that interacted with YB-1 and required for cisplatin resistance. Using the combination of two bioinformatics databases (Oncomine public microarray and genomic hybridization), we focused on the YB-1 protein partners that are potentially involved in cancer progression. We used the siRNA technique to screen different partners of YB-1 that are directly involve in the cisplatin resistance of MCF7 and MDA-MB-231 cells lines. From this analysis, we found that the RPS4X protein, a new partner of YB-1, would be a good marker of cisplatin resistance in breast cancer patients. Interestingly, the YB-1/RPS4X complex was also found in ovarian cancer cells. Like in the breast cancer cell lines, the depletion of RPS4X protein induced the cisplatin resistance of ovarian cancer cells lines (SKOV3 and OVCAR3). Finally, we used a validate antibodies to assess by immunohistochemistry the protein levels of RPS4X and YB-1 in tumor tissue samples from 192 high-grade serous epithelial ovarian cancer patients. We found that RPS4X correlated significantly with ovarian cancer patient outcome. Taken together, these results suggest that, the YB-1/RPS4X complex is a significant potential target to counteract cisplatin resistance in breast and ovarian cancers. Also, we have established that RPS4X is a new promising prognostic marker for patients with high-grade ovarian cancer. More importantly, RPS4X is shown to be predictive of cisplatin response. Additional immunohistochemistry studies on low-grade ovarian cancers and breast cancers are required to confirm the predictive value of RPS4X. Citation Format: Serges P. Tsofack, Liliane Meunier, Anne-Marie Mes-Masson, Michel Lebel. RPS4X, a new prognostic and predictive biomarker of ovarian and breast cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2864. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2864
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».