Induction of the ganglion cell differentiation program in human retinal progenitors before cell cycle exit
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Despite the disease relevance, understanding of human retinal development lags behind that of other species. We compared the kinetics of gene silencing or induction during ganglion cell development in human and murine retina. RESULTS: Induction of POU4F2 (BRN3B) marks ganglion cell commitment, and we detected this factor in S-phase progenitors that had already silenced Cyclin D1 and VSX2 (CHX10). This feature was conserved in human and mouse retina, and the fraction of Pou4f2+ murine progenitors labeled with a 30 min pulse of BrdU matched the fraction of ganglion cells predicted to be born in a half-hour period. Additional analysis of 18 markers revealed many with conserved kinetics, such as the POU4F2 pattern above, as well as the surprising maintenance of "cell cycle" proteins KI67, PCNA, and MCM6 well after terminal mitosis. However, four proteins (TUBB3, MTAP1B, UCHL1, and RBFOX3) showed considerably delayed induction in human relative to mouse retina, and two proteins (ISL1, CALB2) showed opposite kinetics, appearing on either side of terminal mitosis depending on the species. CONCLUSION: With some notable exceptions, human and murine ganglion cell differentiation show similar kinetics, and the data add weight to prior studies supporting the existence of biased ganglion cell progenitors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».