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Enregistrement W1547501051 · doi:10.1002/dvdy.23947

3D imaging, registration, and analysis of the early mouse embryonic vasculature

2013· article· en· W1547501051 sur OpenAlex
Gregory A. Anderson, Michael D. Wong, Jian Yang, R. Mark Henkelman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Dynamics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésBiologySomitogenesisComputational biologyEmbryonic stem cellHeart developmentEmbryoEvolutionary biologyBioinformaticsAnatomyNeuroscienceEmbryogenesisCell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cardiovascular development requires the input of a large number of molecular signaling molecules, and undergoes tightly regulated, three-dimensional developmental patterning. Conventional developmental biology techniques have successfully identified many of the signaling cascades and molecular cues necessary for proper cardiovascular development, which has furnished us with a wealth of biochemical, molecular, and biologically functional information on how tightly linked cardiac and vascular development are. Still missing, however, is a genuine appreciation of the three-dimensional (3D) nature of these important developmental steps. RESULTS: Optical projection tomography (OPT) is a 3D imaging technique that allows for high-resolution imaging of early mouse embryos and their developing cardiovascular systems when a PECAM-1 antibody stain is used to highlight the vascular branching. Reported here is a method in which several 3D images of mouse embryo vasculatures can be registered, thus allowing for analysis of within-strain variance between genetically identical mouse pups. Post-registration, small differences in somitogenesis and ventricular trabeculation patterning can be visualized in mouse pups that differ by as little as a few hours of gestational time. Additionally, similarity metrics (cross-correlation values) can be calculated to quantify similarities and differences. Two different mouse strains are analyzed (C57Bl/6 and CD-1), and similar results are recognized in each strain. CONCLUSIONS: Visualizing the cardiovascular system in such a precise 3D manner allows for more accuracy in describing the steps that take place during cardiovascular development. This novel method will be applicable to many developmental biology questions in other organ systems and other species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,200
Score d'incertitude au seuil0,286

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle