The molecular dimension of microbial species: 2. Synechococcus strains representative of putative ecotypes inhabiting different depths in the Mushroom Spring microbial mat exhibit different adaptive and acclimative responses to light
Notice bibliographique
Résumé
Closely related strains of thermophilic Synechococcus were cultivated from the microbial mats found in the effluent channels of Mushroom Spring, Yellowstone National Park (YNP). These strains have identical or nearly identical 16S rRNA sequences but are representative of separate, predicted putative ecotype (PE) populations, which were identified by using the more highly resolving psaA locus and which predominate at different vertical positions within the 1-mm-thick upper-green layer of the mat. Pyrosequencing confirmed that each strain contained a single, predominant psaA genotype. Strains differed in growth rate as a function of irradiance. A strain with a psaA genotype corresponding to a predicted PE that predominates near the mat surface grew fastest at high irradiances, whereas strains with psaA genotypes representative of predominant subsurface populations grew faster at low irradiance and exhibited greater sensitivity to abrupt shifts to high light. The high-light-adapted and low-light-adapted strains also exhibited differences in pigment content and the composition of the photosynthetic apparatus (photosystem ratio) when grown under different light intensities. Cells representative of the different strains had similar morphologies under low-light conditions, but under high-light conditions, cells of low-light-adapted strains became elongated and formed short chains of cells. Collectively, the results presented here are consistent with the hypothesis that closely related, but distinct, ecological species of Synechococcus occupy different light niches in the Mushroom Spring microbial mat and acclimate differently to changing light environments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».