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Enregistrement W1549384169 · doi:10.1111/bjd.12018

Functional studies for the<i>TRAF6</i>mutation associated with hypohidrotic ectodermal dysplasia

2012· article· en· W1549384169 sur OpenAlexaff
Hiroki Fujikawa, Muhammad Farooq, Atsushi Fujimoto, Masaaki Ito, Yutaka Shimomura

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Dermatology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquedental development and anomalies
Établissements canadiensSKiN Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHypohidrotic ectodermal dysplasiaMutantMutationEctodermal dysplasiaSignal transducing adaptor proteinMutant proteinWild typeImmunoprecipitationBiologyMolecular biologyReceptorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Hypohidrotic ectodermal dysplasia (HED) is a rare condition characterized by hypotrichosis, hypohidrosis and hypodontia. A de novo heterozygous mutation in the tumour necrosis factor receptor-associated factor 6 gene (TRAF6) was recently identified in a patient with HED, while functional consequences resulting from the mutation remained unknown. OBJECTIVES: To determine the mechanism by which the TRAF6 mutation results in HED. METHODS: We performed coimmunoprecipitation (co-IP) studies to determine whether the mutation would affect the interaction of TRAF6 with transforming growth factor β-activated kinase 1 (TAK1), TAK1-binding protein 2 (TAB 2) and ectodysplasin-A receptor-associated death domain protein (EDARADD). We then performed co-IP and glutathione S-transferase-pulldown assays to determine the TRAF6 binding sequences in EDARADD. In addition, we analysed the effect of the mutant TRAF6 protein on the affinity between wild-type TRAF6 and EDARADD, as well as on EDARADD-mediated nuclear factor (NF)-κB activation. RESULTS: The mutant TRAF6 protein was capable of forming a complex with TAK1 and TAB 2 in a similar way to wild-type TRAF6. However, the mutant TRAF6 protein completely lost the affinity to EDARADD, while the wild-type TRAF6 bound to the N-terminal domain of EDARADD. Furthermore, the mutant TRAF6 inhibited the interaction between the wild-type TRAF6 and EDARADD, and also potentially reduced the EDARADD-mediated NF-κB activity. CONCLUSIONS: We conclude that the mutant TRAF6 protein shows a dominant negative effect against the wild-type TRAF6 protein, which is predicted to affect the EDARADD-mediated activation of NF-κB during the development of ectoderm-derived organs, and to lead to the HED phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,286

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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