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Enregistrement W1553611257 · doi:10.1002/cyto.b.21106

Validation of cell‐based fluorescence assays: Practice guidelines from the ICSH and ICCS – part III – analytical issues

2013· review· en· W1553611257 sur OpenAlexaff
Shabnam Tangri, Horacio G Vall, David R. Kaplan, Bob Hoffman, Norman Purvis, Anna Porwit, Ben Hunsberger, T. Vincent Shankey

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensToronto General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeripheral blood mononuclear cellBone marrowStainClinical PracticeCytometryMedicinePathologyBiomedical engineeringComputational biologyStainingFlow cytometryImmunologyChemistryBiologyIn vitroBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clinical diagnostic assays, may be classified as quantitative, quasi-quantitative or qualitative. The assay's description should state what the assay needs to accomplish (intended use or purpose) and what it is not intended to achieve. The type(s) of samples (whole blood, peripheral blood mononuclear cells (PBMC), bone marrow, bone marrow mononuclear cells (BMMC), tissue, fine needle aspirate, fluid, etc.), instrument platform for use and anticoagulant restrictions should be fully validated for stability requirements and specified. When applicable, assay sensitivity and specificity should be fully validated and reported; these performance criteria will dictate the number and complexity of specimen samples required for validation. Assay processing and staining conditions (lyse/wash/fix/perm, stain pre or post, time and temperature, sample stability, etc.) should be described in detail and fully validated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,981
Score d'incertitude au seuil0,103

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0070,004
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,135
Tête enseignante GPT0,470
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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