Intestinal dysbiosis enhances gut microflora‐induced neutrophil extracellular traps (LB517)
Notice bibliographique
Résumé
Antibiotic (Abx) therapy alters gut microbial composition and is associated with an increased risk of pathogen infection. However, little is known about the ability of Abx to foster the growth of pathobionts ‐ commensal microbes that, as a result of select environmental stresses, become pathogenic. Here, we measured the ability of Abx‐disturbed gut microflora to induce neutrophil extracellular traps (NET), protease‐rich ‘footprints’ left by neutrophils to capture and kill microbes. C57BL/6 mice were administered vancomycin (40 mg/kg/d) and gentamicin (3 mg/kg/d) once daily for 3d. Fecal pellets were collected prior to Abx and for 16d thereafter, and incubated in either Tryptic Soy (TS), deMan‐Rogosa‐Sharpe (MRS) or Luria‐Bertani (LB) broth (37°C, 16 h) to enrich either all microbes, Lactobacilli , or Escherichia coli , respectively. The capacity to induce NET from bone marrow‐derived neutrophils (BMDN) was quantified by measurement of extracellular DNA and visualized by fluorescence microscopy. Microbial composition was monitored by qPCR and DGGE. Baseline NET‐activating capacity was present in TS and LB cultures, and was inhibited following Abx. At 10d post‐Abx, LB cultures induced significantly more NET release, indicating overgrowth of immuno‐stimulatory microbes. In combination with compromised epithelial function, the growth of NET‐activating microbes may exacerbate intestinal disease. Grant Funding Source : This work is supported by CIHR (operating grants MOP‐89894, IOP‐92890)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».