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Enregistrement W1556649288 · doi:10.1096/fasebj.28.1_supplement.567.7

Analysis of co‐chaperone interactions with Hsp90 (567.7)

2014· article· en· W1556649288 sur OpenAlexafffund
Annemarie Wolmarans, Paul LaPointe

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHsp90Chaperone (clinical)MutantHeat shock proteinCell biologyComplementationBiochemistryChemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock protein 90 (Hsp90) is a highly abundant, ATP‐dependent molecular chaperone that is present in all eukaryotic cells. It is essential for the maturation and regulation of a specific set of substrate (client) proteins, many of which are key players in oncogenesis. Hsp90, as a homodimer, acts in the context of a complicated ATPase cycle. Co‐chaperone proteins guide and modulate Hsp90 through its functional cycle in order to mature clients, by binding to one or more of Hsp90’s domains in a sequential manner. To address Hsp90’s conformational requirements for cycle progression, we analyze two specific co‐chaperones, Aha1 and Sba1, which bind to Hsp90 in its closed, ATP‐bound state. We have constructed 14 Hsp90 variants harboring mutations in the N terminus of Hsp90 which have the potential to block the binding of Aha1 and Sba1. Several N‐terminal mutants show promising results as they are weakly stimulated by Aha1 or cannot be inhibited by Sba1 from the Aha1‐stimulated rate. Interestingly, one specific mutant harboring the D132K mutation does not interact with Sba1. Analysis of these five mutants in combination with previously characterized Hsp90 mutants will allow for the restriction of either Sba1 or Aha1 to one monomer of Hsp90 or the other. This subunit complementation strategy will bring insight into how Aha1 and Sba1 act asymmetrically on Hsp90. Grant Funding Source : Supported by CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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