Conformational Changes in Pigment–Protein Complexes at Low Temperatures—Spectral Memory and a Possibility of Cooperative Effects
Notice bibliographique
Résumé
We employed nonphotochemical hole burning (NPHB) and fluorescence line narrowing (FLN) spectroscopies to explore protein energy landscapes and energy transfer processes in dimeric Cytochrome b6f, containing one chlorophyll molecule per protein monomer. The parameters of the energy landscape barrier distributions quantitatively agree with those reported for other pigment-protein complexes involved in photosynthesis. Qualitatively, the distributions of barriers between protein substates involved in the light-induced conformational changes (i.e., -NPHB) are close to glass-like ∼1/√V (V is the barrier height) and not to Gaussian. There is a high degree of correlation between the heights of the barriers in the ground and excited states in individual pigment-protein systems, as well as nearly perfect spectral memory. Both NPHB and hole recovery are due to phonon-assisted tunneling associated with the increase of the energy of a scattered phonon. As the latter is unlikely for simultaneously both the hole burning and the hole recovery, proteins must exhibit a NPHB mechanism involving diffusion of the free volume toward the pigment. Entities involved in the light-induced conformational changes are characterized by md(2) value of about 1.0 × 10(-46) kg·m(2). Thus, these entities are protons or, alternatively, small groups of atoms experiencing sub-Å shifts. However, explaining all spectral hole burning and recovery data simultaneously, employing just one barrier distribution, requires a drastic decrease in the attempt frequency to about 100 MHz. This decrease may occur due to cooperative effects. Evidence is presented for excitation energy transfer between the chlorophyll molecules of the adjacent monomers. The magnitude of the dipole-dipole coupling deduced from the Δ-FLN spectra is in good agreement with the structural data, indicating that the explored protein was intact.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».